敦煌市中醫(yī)院始建于1983年，是全省同級中醫(yī)醫(yī)院的首批“二級甲級等在醫(yī)醫(yī)院”和“愛嬰醫(yī)院”。占地面積6231㎡，建筑面積12100㎡，固定資產(chǎn)2020余萬元，開設(shè)病床150張。現(xiàn)有職工190人，其中衛(wèi)生技術(shù)人員148人，高級職稱5人，中級職稱25人，高中級技術(shù)人員占衛(wèi)生技術(shù)人員總數(shù)的20%。擁有CT、進口彩超、血液透析儀、電視胃鏡、500mA電視X光機兼數(shù)字減影、CR、經(jīng)顱多普勒、全自動生化分析儀、全自動精子質(zhì)量分析儀，德國進口膀胱鏡、前列腺汽化電切鏡，美國進口動態(tài)心電血壓監(jiān)測儀，眼底熒光血管造影儀、耳鼻喉綜合檢測儀、微量元素測定儀等先進醫(yī)療設(shè)備150余臺件。設(shè)有中西醫(yī)結(jié)合內(nèi)、外、婦、兒、急診、眼、耳鼻咽喉、口腔、肛腸、泌尿、骨傷等23個臨床科室和放射、檢驗等6個醫(yī)技科室和1個分院、4個社區(qū)服務門診點，是管理科學、設(shè)備先進、醫(yī)療服務范圍、醫(yī)療技術(shù)水平較高的綜合性中醫(yī)醫(yī)院。

敦煌市中醫(yī)院近年來堅持“中醫(yī)為主、中西醫(yī)結(jié)合”的辦院思想，堅持“以人為本、科技興院、專科帶院、服務活院”的辦院思路，把突出中醫(yī)特色，強化專科專病，搞好中醫(yī)藥科研作為重點，不斷加強內(nèi)涵建設(shè)，大膽探索人事、分配制度的改革，使醫(yī)院向高效、優(yōu)質(zhì)、低耗的管理模式發(fā)展，滿足了不同層次人群的醫(yī)療保健需求。中西醫(yī)結(jié)合眼科、肛腸科、泌尿科、創(chuàng)傷科、針灸推拿科、糖尿病、風濕病、哮喘病等專科專病已形成輻射周邊縣區(qū)的特色醫(yī)療。有“自制風濕Ⅱ號電離子導入治療風濕類疾病”、“滋腎蓉精降糖膠囊治療Ⅱ型糖尿病”、“白內(nèi)障囊外摘除加入工晶體植入術(shù)的臨床應用”等20余項科研成果分別榮獲地、市級科技進步獎，有“黃芪注射液治療急性黃疸型甲型肝炎60例”、“化瘀消癖膠囊治療乳腺腺病和乳房纖維囊性增生癥258例臨床總結(jié)”等160余篇學術(shù)論文在國家級、省級刊物上發(fā)表。

敦煌市中醫(yī)院先后榮獲甘肅省誠信建設(shè)單位示范點、地級文明單位、全市窗口行業(yè)創(chuàng)建文明系統(tǒng)示范點、誠信單位、“三&五”普法先進單位、思想政治工作先進集體、民族團結(jié)先進集體等榮譽稱號，同時，長期承擔甘肅中醫(yī)學院、省中醫(yī)學校、酒泉衛(wèi)生學校等院校的教學醫(yī)院工作，并被確定為本市人壽保險公司定點醫(yī)院和遠涉青海海西州、阿克塞等周邊地區(qū)的醫(yī)保定點醫(yī)院。