中國人民解放軍西藏軍區總醫院前身是川東軍區直屬醫院，1949年11月組建于重慶市長壽縣，1955年更名為陸軍第49醫院，同年奉命進藏。1962年被命名為西藏軍區總醫院，并遷入現址。　　

醫院占地面積約41萬余平方米，建筑面積7萬余平方米；編制床位400張，現展開床位550張；編制干部、戰士550人，現有645人；設有4部機關，14個行政科室，29個臨床、醫技科室，以及全軍高山病防治研究中心、全軍拉薩血站、成都軍區創傷外科中心、西藏軍區制劑中心、自治區醫學重點實驗室和中西醫結合研究所；同時為第三軍醫大學拉薩臨床醫學院、西藏大學教學醫院，是集醫療、科研、教學和保健為一體的三級甲等醫院。　　

醫院擁有磁共振、數字減影、CT、X光機、大型高壓氧艙群、中心監護系統等價值4000余萬元的醫療設備；有博士生導師1人、碩士生導師3人、博士后4人、博士研究生13人、碩士研究生48人，臨床一線醫生全部達到了大學本科以上學歷。　　

“九五”期間，全院共獲科技進步獎112項，其中：國家科技進步三等獎l項，軍隊科技進步二等獎6項，自治區科技進步一等獎2項，自治區科技進步二等獎8項，軍隊科技進步三等獎33項，軍隊科技進步四等獎62項。