衛生部中日友好醫院是由日本國政府提供無償援助，中日兩國政府合作建設的大型綜合性現代化醫院。1984年10月23日開院，直屬中華人民共和國衛生部領導。醫院位于北京市朝陽區和平里櫻花東路，占地9.7公頃，目前建筑面積11萬平方米，現編制床位1315張，設有53個臨床、醫技科室，附設中日友好臨床醫學研究所及培訓中心。醫院以疑難疾病、危急重癥診治為重點，以中西醫結合為特色，融醫療、教學、科研、康復和預防保健等多項功能為一體，同時承擔中央干部保健任務以及100多個國家、地區的涉外醫療任務。衛生部中日友好醫院于1993年被評為國家三級甲等醫院,并先后被評為北京市“十佳”醫院和全國“百佳”醫院。2001年被列為中央保健醫院。同時是北京大學臨床醫學院和北京中醫藥大學臨床醫學院。醫院現有副**技術職稱以上人員450余人，碩士研究生學歷以上人員近400人。擁有螺旋掃描CT機、磁共振成像系統、血管造影X線機、醫用直線加速器等性能先進的大型醫療設備。建院以來，承擔了多項**、省部級科研課題，曾獲**、省部級科技進步獎等多項獎勵。醫院的腎內科、神經內科、心臟內科、骨科、中醫腫瘤科承擔國家衛生部臨床學科重點項目；中醫腫瘤科還是國家中醫藥管理局重點學科；電化療科的電化學療法、中醫肛腸科的“安氏療法”是國家衛生部十年百項計劃項目；骨科、中醫風濕病科、電化療科、檢驗科承擔首都醫學發展科研基金重點項目。建院以來，衛生部中日友好醫院作為全國醫療行業對外交流的窗口，曾被外國人在京協會評為“外國人在京就醫國有醫院滿意率**單位”，并與日本、美國、法國、韓國等許多國家的大學、科研單位和醫療機構建立了良好的合作關系。 衛生部中日友好醫院是全國精神文明建設先進單位。2003年，被中共中央確定為全國保持共產黨員先進性教育活動試點單位之一；同年，在抗擊非典斗爭中被指定為非典防治專病醫院，在衛生部黨組的直接領導和全院職工的共同努力下，出色地完成了任務。

先后被評為北京市“十佳”醫院和全國“百佳”醫院。