南京市雨花臺區(qū)婦幼保健所成立于1975年，2004年成為南京市首批省級甲等婦幼保健所，是雨花臺區(qū)的婦幼保健指導中心和人口計生服務中心。
南京市雨花臺區(qū)婦幼保健所堅持婦幼衛(wèi)生公益性質，2006年在南京市率先開展免費婚檢服務，2009年率先開展婦女宮頸癌、乳腺癌檢查項目，2010年全面實施農(nóng)村婦女增補葉酸、農(nóng)村孕產(chǎn)婦住院分娩補助以及預防艾滋病、梅毒、乙肝母嬰傳播等重大婦幼衛(wèi)生項目。免費定期舉辦婚育課堂、孕婦學校、家長學校、兒童“康樂”夏令營、“樂視”訓練營。全區(qū)婦女兒童健康水平不斷提升，2012年，雨花臺區(qū)進入首批江蘇省婦幼衛(wèi)生先進區(qū)行列。
該所積極吸納優(yōu)質資源，先后成立“南京市婦幼保健院社區(qū)婦幼保健基地”、“江蘇省人民醫(yī)院雨花眼保健中心”。開設婦科專家門診、孕婦建卡、婦女病查治、宮頸疾病、乳腺疾病診治、計劃生育技術服務、優(yōu)生優(yōu)育、更年期保健、兒童體檢、智能發(fā)育篩查、眼保健、聽力保健、斜弱視訓練、婦幼營養(yǎng)測評、兒童入園入托體檢等項目。開展嬰兒泳療、兒童早期發(fā)展訓練、婦女產(chǎn)后康復、盆底功能康復等特色服務。
南京市雨花臺區(qū)婦幼保健所加強內(nèi)涵建設，與市婦幼保健院建立科研戰(zhàn)略合作關系，并將該所科研工作納入南京醫(yī)學科技發(fā)展資金平臺，開展常見病、多發(fā)病防治的應用性研究，現(xiàn)已開展省、市、區(qū)科研課題11項，在國際期刊發(fā)表論文1篇，社區(qū)兒童眼保健模式多次在全國交流，取得了積極廣泛的影響。
南京市雨花臺區(qū)婦幼保健所榮獲江蘇省文明單位、南京市文明單位表彰，被授予江蘇省“群眾滿意醫(yī)療衛(wèi)生機構”、“巾幗文明崗”稱號以及南京市“五一勞動獎狀”，多次被評為雨花臺區(qū)先進集體。