昆明市兒童醫(yī)院前身是1920年英國教會（中華圣公會）創(chuàng)辦的教會醫(yī)院——“惠滇醫(yī)院”。1950年，由昆明市人民政府接管，作為昆明陸軍醫(yī)院的婦產(chǎn)分院，于1958年改建為昆明兒童專科醫(yī)院。目前已成為云南省唯一一所集醫(yī)療、教學、科研、保健、預防為一體的兒童綜合性醫(yī)院。
　　昆明市兒童醫(yī)院現(xiàn)有正式職工931人，衛(wèi)生技術人員758人，高級職稱及碩士生導師以上專家102人，市級、局級、院級學科帶頭人及后備人32名，博士、碩士研究生63名。醫(yī)院核定床位300張，實際開放床位500張。日診治門、急診患兒近3000人，年門診人次80余萬，年搶救轉診危、急、重癥患兒萬余人，搶救成功率98.1%。兩年后新院建成，醫(yī)院規(guī)模將達到1000張床，綜合服務能力大大提高。成為一所面向全省，輻射周邊和東南亞地區(qū)的現(xiàn)代化兒童醫(yī)療康復中心。
　　昆明市兒童醫(yī)院目前設有28個臨床醫(yī)技科室。有省級醫(yī)學研究中心5個，市級醫(yī)學重點學科5個和醫(yī)學研究（技術）中心10個。設有PICU、NICU、CCU，內(nèi)、外科實行二級分科，小兒眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、兒保部、康復科、檢驗科、中心實驗室、放射科、病理科等，各醫(yī)技功能科室齊全。醫(yī)療設備先進，有雙排螺旋CT、DR、CR、雙C臂數(shù)字減影系統(tǒng)、全自動生化分析儀，多普勒彩色超聲儀等100余臺各種大中型醫(yī)療儀器設備。醫(yī)院在省內(nèi)率先完成了His系統(tǒng)和Pacs系統(tǒng)的融合、建立了Lis系統(tǒng)、醫(yī)療一卡通信息收費系統(tǒng)、醫(yī)生工作站、排隊呼叫系統(tǒng)等，為現(xiàn)代化、數(shù)字化醫(yī)院奠定了堅實基礎。保證了醫(yī)療、教學、科研、工作的開展。醫(yī)院現(xiàn)已成為昆明醫(yī)學院、大理學院、昆明市衛(wèi)生學校、楚雄市衛(wèi)生專科學校教學醫(yī)院和兒科碩士點分部，并已開展了研究生的培養(yǎng)工作。每年有多項科研成果獲省、市科技進步獎，有上百篇論文發(fā)表在國家級、省級專業(yè)期刊上。醫(yī)院擁有一支老中青的兒科專業(yè)技術人才隊伍。醫(yī)院與國際組織機構有多項合作項目，得到國際有關組織的贊譽和省、市各級政府的嘉獎、表彰，獲得省、市先進集體、市級文明單位等榮譽稱號。
　　昆明市兒童醫(yī)院承擔著繁重的醫(yī)療、保健、科研和教學任務，為推動昆明地區(qū)及全省兒科醫(yī)學的發(fā)展，挽救患兒的生命，促進兒童健康，提高人口素質，做出了十分重要的貢獻。
兒童是祖國的未來，民族的希望，兒童的健康關系著家庭幸福，社會進步，國家發(fā)展，加強兒童醫(yī)療保健事業(yè)責任重大，意義深遠。根據(jù)昆明市“十一五”衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展規(guī)劃和區(qū)域衛(wèi)生規(guī)劃，為了科學合理地配置醫(yī)療資源，滿足日益增加的兒童醫(yī)療服務需求，解決病人看病難的問題，省委、省政府和市委、市政府高度重視，結合現(xiàn)代新昆明建設發(fā)展規(guī)劃，將兒童醫(yī)院南市區(qū)新建項目納入昆明市“十一五”規(guī)劃和重點建設項目，決定在南市區(qū)建設一所代表全省最高兒童醫(yī)療水平的大型綜合性兒童醫(yī)院，新院總用地面積113畝，投資6.9億，建筑面積達11萬余平方米，設置床位800張，日接診量可達5000人次，年門診量可突破100萬人次，年收治住院病人約3萬人次。醫(yī)院將以改革和項目推進為契機，抓住機遇，加快改革步伐，不斷提高醫(yī)院管理水平和醫(yī)療服務質量，把醫(yī)院建設成為一所集醫(yī)療、教學、科研、預防、保健、康復于一體；技術精湛，設施精良、服務優(yōu)質、管理高效；學科特色鮮明，整體實力雄厚；立足云南，輻射周邊地區(qū)，面向東南亞的現(xiàn)代化綜合性兒童醫(yī)學中心。