犍為縣馬廟鄉衛生院始建于1951年7月，經過馬廟鄉聯合診所、馬廟公社醫院、馬廟區人民醫院、馬廟公社聯診所、馬廟公社衛生院、馬廟鄉衛生院6次演變于2002年10月止，由犍為縣政府變賣成私立醫院，命名為馬廟鄉衛生院。至2007年2月在黨的正確領導下，每個鄉鎮必須有一所公立醫院，由國家出資13萬，政府配套資金17萬（其中5萬元由新建衛生院立負債），建立了現在的馬廟鄉衛生院，建筑面積770個平方，使用面積550平方。所建醫院負責本轄區的衛生行政、預防保健、診療與護理、健康教育、公共衛生工作以及鄉村醫生的培訓和繼續教育。人員編制7人，在職人數8人，其中執業醫師1人，執業助理醫師2人，藥師1人，醫士2人，護士1人，工人1人，開設預防保健、內科、中醫科等醫療項目，設病床10張，每月平均住院人次17人。