新疆醫科大學第五附屬醫院（原烏魯木齊鐵路中心醫院）成立于1937年，至今具有70年的輝煌歷史。其前身為“鎮江鐵路醫院”，1958年以“蘭州基地醫院”進疆后，更名為烏魯木齊鐵路局中心醫院。2004年6月，隨著鐵路主輔分離改革，醫院整建制移交新疆醫科大學，成為新疆醫科大學第五附屬醫院暨第五臨床醫學院。

新疆醫科大學第五附屬醫院地址為河南西路118號，地處鐵路局商業圈中心，東鄰北京路，北靠河南路，周邊有瑞豪大酒店、紅樓大酒店、西單商場、五一商場等大型酒店及商場。

新疆醫科大學第五附屬醫院總占地面積52880平方米，建筑面積79744平方米；目前編制床位549張，開放床位787張；設有臨床、醫技等專業科室46個，行政職能部門16個；目前年門診量三十萬人次，年出院病人一萬余人次。

新疆醫科大學第五附屬醫院在職職工950人，專業技術人員743人，行政人員117，工勤人員91人，其中高級技術人員114人，有4人享受國務院政府特殊津貼，還擁有鐵道部命名的“有特殊貢獻專家”、“優秀科技工作者”等一批拔尖人才。

新疆醫科大學第五附屬醫院長期以來，遵循“突出特色，重視人才，崇尚人文，遵循科學”的辦院方針，逐漸形成了一批有實力的臨床三級學科，有些學科進入區內同行先進序列。其中心血管內科、骨科、放射科曾是鐵道部重點專科，在自治區同行中享有盛譽。近年來，醫院努力打造科室特色，專科優勢逐漸凸顯，一批有實力的科室如：心血管內科、泌尿外科、腫瘤外科、骨科、神經內科、內分泌科、職業病防治科、康復醫學科逐漸脫穎而出。

新疆醫科大學第五附屬醫院擁有全身CT、CR、LCV心血管數字減影機、德國西門子16排螺旋CT、1.5TMRI和西門子最新型DR，心臟彩色多普勒超聲診斷儀，全自動生化分析儀、體外碎石機、醫用直線加速器、輸尿管腎鏡與氣壓彈道碎石機、電子輸尿管鏡及氣壓彈道碎石機、前列腺汽化電切及腹腔鏡、關節鏡、間盤鏡，尿流動力學分析儀等自治區一流的現代化醫療設備，先進的設施裝備使優質的醫療服務有了保障。

新疆醫科大學第五附屬醫院作為新疆醫科大學第五臨床醫學院，承擔著22個班級9200多個學時的教學、實習任務，設有內、外、婦、兒等8個臨床教研室，具有教師資格的專業技術人員170余名，有9名專家具有碩士生導師資格。近年來，科研工作也有了新進展，除了承擔新疆醫科大學科研項目外，還承擔了多項自治區級科研項目。

新疆醫科大學第五附屬醫院是一所集醫療、教學、科研、預防為一體的綜合性三級甲等醫院。是自治區唯一一所擁有職業病臨床床位的大型綜合醫院，是自治區醫保、烏魯木齊市醫保、鐵路醫保、商業保險、新農合的定點醫療機構，是中西部地區兒童先天性疾病和貧困白內障患者復明救治定點醫療單位，是新市區牙病防治中心、自治區白內障定點復明醫院，曾獲全國“衛生文明建設先進單位”，連續六屆榮獲自治區級“文明單位”榮譽稱號。