安徽中醫(yī)藥大學(xué)第二附屬醫(yī)院創(chuàng)建于1985年，是全國最早成立和規(guī)模最大的省級針灸專科醫(yī)院，2005年在全國率先獲得三級甲等中醫(yī)針灸專科醫(yī)院。是國家中醫(yī)藥管理局“中醫(yī)藥國際合作基地”、世界針灸學(xué)會聯(lián)合會“臨床基地”、國家中醫(yī)藥管理局“中醫(yī)藥標準化研究推廣基地”和中國針灸學(xué)會“針灸標準化研究示范基地”。醫(yī)院歷經(jīng)20多年的建設(shè)與發(fā)展，認真貫徹落實黨和國家衛(wèi)生與中醫(yī)藥工作方針政策，堅持“大專科、小綜合”的發(fā)展模式，堅持“以針灸特色求生存、以專科優(yōu)勢求發(fā)展”的辦院方向，各項工作取得了顯著地成效。醫(yī)院床位規(guī)模進一步擴大，醫(yī)療服務(wù)質(zhì)量和效益明顯提高；針灸特色優(yōu)勢進一步發(fā)揮，特色中醫(yī)院、重點學(xué)科和重點專科專病建設(shè)得到加強；人才隊伍素質(zhì)進一步提高，臨床、教學(xué)和科研水平有所提升；對外交流和社會影響進一步擴大，職工凝聚力和發(fā)展信心不斷增強。

　　醫(yī)院現(xiàn)有編制床位300張，開放床位800張，擁有3個國家級臨床重點專科，2個國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科，6個國家中醫(yī)藥管理局重點專科。擁有全國名老中醫(yī)學(xué)術(shù)經(jīng)驗繼承導(dǎo)師4人，全國中醫(yī)藥優(yōu)秀臨床人才3人，首屆“江淮名醫(yī)”5人，安徽省中醫(yī)藥學(xué)科帶頭人第一層次8人，碩士研究生導(dǎo)師16人，設(shè)有6個臨床教研室，為針灸臨床專業(yè)碩士點，先后接收了美國、加拿大、法國、德國、澳大利亞、日本、韓國、新加坡等國家的留學(xué)生、進修生及碩士研究生100多人，有40多名專家赴美國、德國、瑞士、法國、英國、澳大利亞、新加坡、也門、伊朗等國家進行學(xué)術(shù)交流，與德國、波蘭、新加坡、瑞士等國建立了聯(lián)合辦醫(yī)、辦學(xué)、學(xué)歷教育等合作項目，參加也門等援外醫(yī)療工作。近五年來承擔(dān)了國家級科研課題3項、省部級4項、廳局級35項，獲得省科技成果獎2項，國家發(fā)明專利11項。醫(yī)院現(xiàn)已逐步形成了以針灸專科為龍頭，以腦病科、骨傷科、老年病科、脾胃病科和康復(fù)科為主體，以一批特色專科專病建設(shè)為支撐，以開展和應(yīng)用各類特色針灸療法并結(jié)合推拿、手法、中藥、康復(fù)等為主要治療手段，以一批具有較好療效優(yōu)勢病種為標志的中醫(yī)針灸臨床學(xué)科構(gòu)架和體系，取得了較大的特色專科規(guī)模效應(yīng)和良好的經(jīng)濟社會效益。醫(yī)院2012年門診病人、出院人次、業(yè)務(wù)收入與“十一五”期末相比分別增長124%;、114%;、178%;，門診非藥物中醫(yī)特色治療比例達到90%;以上，病房及門診中醫(yī)治療率分別達到75%;、92%;，中醫(yī)治療和中藥費用占業(yè)務(wù)收入比例達60%;以上。

　　當(dāng)前，中醫(yī)藥事業(yè)的發(fā)展得到了前所未有的高度重視和支持，國務(wù)院《關(guān)于扶持和促進中醫(yī)藥事業(yè)發(fā)展的若干意見》提出了一系列政策和措施。安徽省委、省政府《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的實施意見》把扶持和促進中醫(yī)藥發(fā)展列為今后3年醫(yī)改6項重點任務(wù)之一，明確提出要“大力推進以針灸學(xué)術(shù)研究為重點的國家中醫(yī)藥國際交流與合作基地建設(shè)”。安徽省政府《關(guān)于進一步加快中醫(yī)藥事業(yè)發(fā)展的意見》對針灸醫(yī)院的建設(shè)也提出了明確的目標。衛(wèi)生部副部長、國家中醫(yī)藥管理局局長王國強曾兩次視察醫(yī)院，并在中國針灸學(xué)會第五次全國會員代表大會上明確表示要支持像安徽中醫(yī)學(xué)院附屬針灸醫(yī)院一樣的針灸專科醫(yī)院的建設(shè)和發(fā)展。

　　面向“十二五”，醫(yī)院將繼續(xù)堅持以科學(xué)發(fā)展觀為統(tǒng)領(lǐng)，堅持以人為本和以病人為中心的服務(wù)宗旨，堅持以針灸特色立院、以專科優(yōu)勢興院、以質(zhì)量效益強院辦院方向，堅持實施“名院、名科、名醫(yī)”的發(fā)展戰(zhàn)略，堅持以專科專病建設(shè)為重點、以人才隊伍建設(shè)為關(guān)鍵、以完善基礎(chǔ)功能為支撐、以擴大對外交流為延伸、以深化改革創(chuàng)新為動力，以強化管理服務(wù)為保障的發(fā)展思路，實現(xiàn)“規(guī)模結(jié)構(gòu)合理、特色優(yōu)勢凸顯、質(zhì)量效益較高、管理服務(wù)較好，引領(lǐng)全省、輻射全國、面向國際的現(xiàn)代化、專科性、研究型中醫(yī)針灸醫(yī)院”的建設(shè)目標，努力把醫(yī)院建設(shè)成為具有國內(nèi)領(lǐng)先水平、在國際上有重要影響的針灸醫(yī)學(xué)基地，成為針灸醫(yī)療、科研和人才培養(yǎng)的中心，成為祖國傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)國際交流與合作的窗口，成為安徽省中醫(yī)藥事業(yè)的知名品牌。