合肥長江醫院按二級甲等規模設置的綜合醫院，科室設置有內科、外科、骨科、婦科、兒科、產科、五官科、耳鼻喉科、口腔科、泌尿科、皮膚科、肛腸科、中醫科、不孕不育科、計劃生育、醫學美容、微創中心、影像中心、體檢中心、手術中心、康復中心、檢驗中心、急診醫學等科室。

醫院有德國西門子多排螺旋CT、500毫安雙床電視X光機、韓國DR數字成像系統、德國宮.腹腔鏡、瑞士經皮腎鏡、法國產全自動血細胞分析儀、邁瑞大型全自動生化儀、血凝儀、尿分析儀、全自動電解質分析儀、美國GE四維彩超、動態心電圖儀、腦電圖儀、腦地型圖儀、日本奧林巴斯電子胃鏡、心電除顫監護儀、產前監護儀、丹麥產新生兒聽力篩查儀、鈥激光碎石機、大型體外短波治療儀、臭氧治療儀、微波治療儀、紅外治療儀、復合光譜治療儀、LEEP刀等檢查、治療、分析儀。

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