南京市胸科醫院建于1950年，是江蘇省規模最大的胸部專科醫院，承擔著省、市胸部疾病的醫療、教學、科研任務。是"東南大學醫學院教學醫院"、"南京肺灌洗中心"、"南京市結核病研究所"。2003年與澳大利亞阿爾弗雷德醫院建立友好醫院及科研技術合作伙伴關系，2004年成功地為兩例終末期慢性阻塞性肺病患者實施了單肺移植、對側肺減容術，填補了南京地區人體肺移植技術的空白。2005年加入鼓醫集團后，

　　與鼓樓醫院胸心外科聯合成立了"鼓醫集團心血管病中心"。2006年已申報肺癌診治中心。醫院在胸部疾病的診斷、治療等方面，具有較高的專科水平而享譽省內外。

　　目前醫院擁有編制床位500張，設有胸外科、呼吸內科、結核病科、心血管內科、心臟外科、麻醉科、放療科、中西醫結合科、急救中心等11個臨床科室，其中胸外科為南京市重點專科；設有醫學影像科、檢驗科、病理科、心導管室、氣管鏡室等10個醫技科室；另有中心實驗室、胸心外科研究室、胸部腫瘤研究室、肺結核病研究室等。隨著醫院新病房大樓的建成和使用，業務和床位將會進一步得到拓展。

　　醫院現有醫療設備1030臺（件），總價值4500多萬元。主要醫療設備有：鈷-60治療機、模擬定位機、螺旋CT機、胸腔鏡、縱隔鏡、DSA、主動脈內球囊反博泵、數字化胸片機、結核桿菌快速培養儀、動態心電圖、麻醉機、呼吸機、肺功能機、彩色多普勒診斷儀、全自動系列生化分析儀、血氣分析儀、移動式X線機和ICU中央監護設備等。
　　醫院科研工作生機勃勃，成績斐然。共獲國家、省、市、局科研成果獎近60項.在市級以上雜志發表學術論文600多篇，參加國際性學術會議10多次。

　　醫院是南京市"花園式單位"和"花園式醫院"，醫院多次被南京市政府、江蘇省衛生廳、南京市衛生局授予"文明單位"、"文明醫院"、"先進基層黨組織"等光榮稱號。